Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cspp1B2RX88 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cspp1B2RX88 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cspp1B2RX88 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cspp1B2RX88 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cspp1B2RX88 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cspp1B2RX88 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cspp1B2RX88 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cspp1B2RX88 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cspp1B2RX88 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cspp1B2RX88 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cspp1B2RX88 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Cspp1B2RX88 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Cspp1B2RX88 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cspp1B2RX88 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cspp1B2RX88 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cspp1B2RX88 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cspp1B2RX88 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cspp1B2RX88 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Cspp1B2RX88 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cspp1B2RX88 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cspp1B2RX88 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cspp1B2RX88 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cspp1B2RX88 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cspp1B2RX88 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cspp1B2RX88 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cspp1B2RX88 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Cspp1B2RX88 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cspp1B2RX88 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cspp1B2RX88 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cspp1B2RX88 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Cspp1B2RX88 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cspp1B2RX88 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cspp1B2RX88 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Cspp1B2RX88 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cspp1B2RX88 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cspp1B2RX88 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cspp1B2RX88 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Cspp1B2RX88 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cspp1B2RX88 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cspp1B2RX88 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cspp1B2RX88 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cspp1B2RX88 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cspp1B2RX88 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cspp1B2RX88 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cspp1B2RX88 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cspp1B2RX88 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cspp1B2RX88 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cspp1B2RX88 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cspp1B2RX88 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cspp1B2RX88 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cspp1B2RX88 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cspp1B2RX88 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cspp1B2RX88 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Cspp1B2RX88 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cspp1B2RX88 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cspp1B2RX88 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cspp1B2RX88 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cspp1B2RX88 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cspp1B2RX88 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cspp1B2RX88 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cspp1B2RX88 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Cspp1B2RX88 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cspp1B2RX88 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cspp1B2RX88 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cspp1B2RX88 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
Cspp1B2RX88 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cspp1B2RX88 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cspp1B2RX88 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cspp1B2RX88 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cspp1B2RX88 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cspp1B2RX88 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cspp1B2RX88 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cspp1B2RX88 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cspp1B2RX88 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Cspp1B2RX88 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cspp1B2RX88 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cspp1B2RX88 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cspp1B2RX88 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cspp1B2RX88 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cspp1B2RX88 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cspp1B2RX88 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cspp1B2RX88 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cspp1B2RX88 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cspp1B2RX88 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cspp1B2RX88 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cspp1B2RX88 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cspp1B2RX88 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cspp1B2RX88 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cspp1B2RX88 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cspp1B2RX88 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cspp1B2RX88 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Cspp1B2RX88 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cspp1B2RX88 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cspp1B2RX88 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cspp1B2RX88 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cspp1B2RX88 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cspp1B2RX88 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Cspp1B2RX88 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cspp1B2RX88 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms