Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Cfap58B2RW38 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Cfap58B2RW38 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Cfap58B2RW38 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Cfap58B2RW38 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Cfap58B2RW38 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Cfap58B2RW38 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Cfap58B2RW38 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Cfap58B2RW38 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Cfap58B2RW38 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Cfap58B2RW38 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Cfap58B2RW38 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Cfap58B2RW38 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Cfap58B2RW38 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Cfap58B2RW38 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Cfap58B2RW38 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Cfap58B2RW38 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Cfap58B2RW38 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Cfap58B2RW38 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cfap58B2RW38 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Cfap58B2RW38 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Cfap58B2RW38 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Cfap58B2RW38 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Cfap58B2RW38 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Cfap58B2RW38 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Cfap58B2RW38 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Cfap58B2RW38 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Cfap58B2RW38 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Cfap58B2RW38 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Cfap58B2RW38 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Cfap58B2RW38 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Cfap58B2RW38 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Cfap58B2RW38 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Cfap58B2RW38 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Cfap58B2RW38 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Cfap58B2RW38 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Cfap58B2RW38 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Cfap58B2RW38 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Cfap58B2RW38 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Cfap58B2RW38 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Cfap58B2RW38 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Cfap58B2RW38 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Cfap58B2RW38 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Cfap58B2RW38 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Cfap58B2RW38 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Cfap58B2RW38 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Cfap58B2RW38 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Cfap58B2RW38 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cfap58B2RW38 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cfap58B2RW38 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,27■■■□□ 2,28
Cfap58B2RW38 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Cfap58B2RW38 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Cfap58B2RW38 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Cfap58B2RW38 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Cfap58B2RW38 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Cfap58B2RW38 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Cfap58B2RW38 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Cfap58B2RW38 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Cfap58B2RW38 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Cfap58B2RW38 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,14■■■□□ 2,25
Cfap58B2RW38 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Cfap58B2RW38 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Cfap58B2RW38 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Cfap58B2RW38 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Cfap58B2RW38 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Cfap58B2RW38 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Cfap58B2RW38 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Cfap58B2RW38 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Cfap58B2RW38 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Cfap58B2RW38 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Cfap58B2RW38 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Cfap58B2RW38 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Cfap58B2RW38 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Cfap58B2RW38 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Cfap58B2RW38 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cfap58B2RW38 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cfap58B2RW38 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cfap58B2RW38 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cfap58B2RW38 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Cfap58B2RW38 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Cfap58B2RW38 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Cfap58B2RW38 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Cfap58B2RW38 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Cfap58B2RW38 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cfap58B2RW38 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cfap58B2RW38 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Cfap58B2RW38 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Cfap58B2RW38 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Cfap58B2RW38 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Cfap58B2RW38 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Cfap58B2RW38 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Cfap58B2RW38 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Cfap58B2RW38 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Cfap58B2RW38 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Cfap58B2RW38 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Cfap58B2RW38 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Cfap58B2RW38 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
Cfap58B2RW38 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
Cfap58B2RW38 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Cfap58B2RW38 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,2 ms