Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrn3B2RS91 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rrn3B2RS91 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rrn3B2RS91 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rrn3B2RS91 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rrn3B2RS91 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rrn3B2RS91 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rrn3B2RS91 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rrn3B2RS91 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rrn3B2RS91 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rrn3B2RS91 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rrn3B2RS91 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrn3B2RS91 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrn3B2RS91 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrn3B2RS91 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrn3B2RS91 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rrn3B2RS91 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rrn3B2RS91 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rrn3B2RS91 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rrn3B2RS91 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rrn3B2RS91 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rrn3B2RS91 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rrn3B2RS91 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rrn3B2RS91 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rrn3B2RS91 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rrn3B2RS91 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rrn3B2RS91 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rrn3B2RS91 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rrn3B2RS91 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rrn3B2RS91 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rrn3B2RS91 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rrn3B2RS91 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rrn3B2RS91 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rrn3B2RS91 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rrn3B2RS91 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rrn3B2RS91 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rrn3B2RS91 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rrn3B2RS91 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rrn3B2RS91 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rrn3B2RS91 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rrn3B2RS91 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rrn3B2RS91 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rrn3B2RS91 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rrn3B2RS91 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rrn3B2RS91 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rrn3B2RS91 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rrn3B2RS91 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rrn3B2RS91 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rrn3B2RS91 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rrn3B2RS91 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rrn3B2RS91 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rrn3B2RS91 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rrn3B2RS91 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rrn3B2RS91 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rrn3B2RS91 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rrn3B2RS91 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rrn3B2RS91 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrn3B2RS91 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrn3B2RS91 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrn3B2RS91 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrn3B2RS91 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrn3B2RS91 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrn3B2RS91 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rrn3B2RS91 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rrn3B2RS91 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrn3B2RS91 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrn3B2RS91 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrn3B2RS91 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrn3B2RS91 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrn3B2RS91 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrn3B2RS91 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rrn3B2RS91 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrn3B2RS91 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrn3B2RS91 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrn3B2RS91 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrn3B2RS91 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrn3B2RS91 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrn3B2RS91 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrn3B2RS91 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrn3B2RS91 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrn3B2RS91 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rrn3B2RS91 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrn3B2RS91 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rrn3B2RS91 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rrn3B2RS91 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rrn3B2RS91 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rrn3B2RS91 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rrn3B2RS91 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rrn3B2RS91 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Rrn3B2RS91 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrn3B2RS91 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrn3B2RS91 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrn3B2RS91 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrn3B2RS91 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrn3B2RS91 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrn3B2RS91 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrn3B2RS91 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrn3B2RS91 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rrn3B2RS91 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrn3B2RS91 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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