Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Brpf1B2RRD7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Brpf1B2RRD7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Brpf1B2RRD7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Brpf1B2RRD7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Brpf1B2RRD7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Brpf1B2RRD7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Brpf1B2RRD7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Brpf1B2RRD7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Brpf1B2RRD7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Brpf1B2RRD7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Brpf1B2RRD7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Brpf1B2RRD7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Brpf1B2RRD7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Brpf1B2RRD7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Brpf1B2RRD7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Brpf1B2RRD7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Brpf1B2RRD7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Brpf1B2RRD7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Brpf1B2RRD7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Brpf1B2RRD7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Brpf1B2RRD7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Brpf1B2RRD7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Brpf1B2RRD7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Brpf1B2RRD7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Brpf1B2RRD7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Brpf1B2RRD7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Brpf1B2RRD7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Brpf1B2RRD7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Brpf1B2RRD7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Brpf1B2RRD7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Brpf1B2RRD7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Brpf1B2RRD7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Brpf1B2RRD7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Brpf1B2RRD7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Brpf1B2RRD7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Brpf1B2RRD7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Brpf1B2RRD7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Brpf1B2RRD7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Brpf1B2RRD7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Brpf1B2RRD7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Brpf1B2RRD7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Brpf1B2RRD7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Brpf1B2RRD7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Brpf1B2RRD7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Brpf1B2RRD7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Brpf1B2RRD7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Brpf1B2RRD7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Brpf1B2RRD7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Brpf1B2RRD7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Brpf1B2RRD7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Brpf1B2RRD7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Brpf1B2RRD7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Brpf1B2RRD7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Brpf1B2RRD7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Brpf1B2RRD7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Brpf1B2RRD7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Brpf1B2RRD7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Brpf1B2RRD7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Brpf1B2RRD7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Brpf1B2RRD7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Brpf1B2RRD7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Brpf1B2RRD7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Brpf1B2RRD7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Brpf1B2RRD7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Brpf1B2RRD7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Brpf1B2RRD7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Brpf1B2RRD7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Brpf1B2RRD7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Brpf1B2RRD7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Brpf1B2RRD7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Brpf1B2RRD7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Brpf1B2RRD7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Brpf1B2RRD7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Brpf1B2RRD7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Brpf1B2RRD7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Brpf1B2RRD7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Brpf1B2RRD7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Brpf1B2RRD7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Brpf1B2RRD7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Brpf1B2RRD7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Brpf1B2RRD7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Brpf1B2RRD7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Brpf1B2RRD7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Brpf1B2RRD7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Brpf1B2RRD7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Brpf1B2RRD7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Brpf1B2RRD7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Brpf1B2RRD7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Brpf1B2RRD7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Brpf1B2RRD7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Brpf1B2RRD7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Brpf1B2RRD7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Brpf1B2RRD7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Brpf1B2RRD7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Brpf1B2RRD7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Brpf1B2RRD7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Brpf1B2RRD7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Brpf1B2RRD7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Brpf1B2RRD7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms