Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
1700042G07RikB1AUF7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
1700042G07RikB1AUF7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
1700042G07RikB1AUF7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
1700042G07RikB1AUF7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
1700042G07RikB1AUF7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
1700042G07RikB1AUF7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700042G07RikB1AUF7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700042G07RikB1AUF7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
1700042G07RikB1AUF7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
1700042G07RikB1AUF7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700042G07RikB1AUF7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700042G07RikB1AUF7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700042G07RikB1AUF7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
1700042G07RikB1AUF7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms