Protein–RNA interactions for Protein: A2BG94

Gm6890, Predicted gene 6890, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6890A2BG94 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm6890A2BG94 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm6890A2BG94 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6890A2BG94 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm6890A2BG94 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm6890A2BG94 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm6890A2BG94 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm6890A2BG94 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm6890A2BG94 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm6890A2BG94 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm6890A2BG94 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm6890A2BG94 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm6890A2BG94 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm6890A2BG94 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm6890A2BG94 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm6890A2BG94 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm6890A2BG94 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm6890A2BG94 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm6890A2BG94 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm6890A2BG94 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm6890A2BG94 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm6890A2BG94 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm6890A2BG94 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm6890A2BG94 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm6890A2BG94 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm6890A2BG94 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm6890A2BG94 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm6890A2BG94 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm6890A2BG94 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm6890A2BG94 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm6890A2BG94 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm6890A2BG94 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm6890A2BG94 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm6890A2BG94 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm6890A2BG94 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm6890A2BG94 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm6890A2BG94 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm6890A2BG94 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm6890A2BG94 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm6890A2BG94 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm6890A2BG94 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm6890A2BG94 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm6890A2BG94 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm6890A2BG94 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm6890A2BG94 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm6890A2BG94 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm6890A2BG94 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm6890A2BG94 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm6890A2BG94 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm6890A2BG94 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm6890A2BG94 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm6890A2BG94 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm6890A2BG94 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm6890A2BG94 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm6890A2BG94 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm6890A2BG94 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm6890A2BG94 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm6890A2BG94 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6890A2BG94 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6890A2BG94 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm6890A2BG94 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6890A2BG94 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm6890A2BG94 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm6890A2BG94 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6890A2BG94 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6890A2BG94 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6890A2BG94 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm6890A2BG94 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6890A2BG94 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm6890A2BG94 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6890A2BG94 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm6890A2BG94 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm6890A2BG94 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm6890A2BG94 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6890A2BG94 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm6890A2BG94 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6890A2BG94 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm6890A2BG94 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm6890A2BG94 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6890A2BG94 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm6890A2BG94 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm6890A2BG94 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm6890A2BG94 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm6890A2BG94 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6890A2BG94 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6890A2BG94 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm6890A2BG94 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6890A2BG94 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6890A2BG94 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6890A2BG94 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6890A2BG94 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6890A2BG94 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6890A2BG94 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6890A2BG94 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6890A2BG94 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6890A2BG94 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6890A2BG94 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6890A2BG94 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6890A2BG94 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6890A2BG94 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms