Protein–RNA interactions for Protein: A2ARP9

Catsper2, Cation channel sperm-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper2A2ARP9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Catsper2A2ARP9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Catsper2A2ARP9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Catsper2A2ARP9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Catsper2A2ARP9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Catsper2A2ARP9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Catsper2A2ARP9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Catsper2A2ARP9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Catsper2A2ARP9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Catsper2A2ARP9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Catsper2A2ARP9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Catsper2A2ARP9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Catsper2A2ARP9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Catsper2A2ARP9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Catsper2A2ARP9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Catsper2A2ARP9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Catsper2A2ARP9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Catsper2A2ARP9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Catsper2A2ARP9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Catsper2A2ARP9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Catsper2A2ARP9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Catsper2A2ARP9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Catsper2A2ARP9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Catsper2A2ARP9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Catsper2A2ARP9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Catsper2A2ARP9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Catsper2A2ARP9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Catsper2A2ARP9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Catsper2A2ARP9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Catsper2A2ARP9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Catsper2A2ARP9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Catsper2A2ARP9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Catsper2A2ARP9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Catsper2A2ARP9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Catsper2A2ARP9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Catsper2A2ARP9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Catsper2A2ARP9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Catsper2A2ARP9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Catsper2A2ARP9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Catsper2A2ARP9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Catsper2A2ARP9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Catsper2A2ARP9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Catsper2A2ARP9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Catsper2A2ARP9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Catsper2A2ARP9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Catsper2A2ARP9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Catsper2A2ARP9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Catsper2A2ARP9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Catsper2A2ARP9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Catsper2A2ARP9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Catsper2A2ARP9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Catsper2A2ARP9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Catsper2A2ARP9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Catsper2A2ARP9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Catsper2A2ARP9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Catsper2A2ARP9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Catsper2A2ARP9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Catsper2A2ARP9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Catsper2A2ARP9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Catsper2A2ARP9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Catsper2A2ARP9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Catsper2A2ARP9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Catsper2A2ARP9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Catsper2A2ARP9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Catsper2A2ARP9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Catsper2A2ARP9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Catsper2A2ARP9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Catsper2A2ARP9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Catsper2A2ARP9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Catsper2A2ARP9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Catsper2A2ARP9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Catsper2A2ARP9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Catsper2A2ARP9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Catsper2A2ARP9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Catsper2A2ARP9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Catsper2A2ARP9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Catsper2A2ARP9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Catsper2A2ARP9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Catsper2A2ARP9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Catsper2A2ARP9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Catsper2A2ARP9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Catsper2A2ARP9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Catsper2A2ARP9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Catsper2A2ARP9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Catsper2A2ARP9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Catsper2A2ARP9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Catsper2A2ARP9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Catsper2A2ARP9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Catsper2A2ARP9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Catsper2A2ARP9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Catsper2A2ARP9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Catsper2A2ARP9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Catsper2A2ARP9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Catsper2A2ARP9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Catsper2A2ARP9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Catsper2A2ARP9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Catsper2A2ARP9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Catsper2A2ARP9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Catsper2A2ARP9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Catsper2A2ARP9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms