Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd60A2AMD2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd60A2AMD2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd60A2AMD2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd60A2AMD2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd60A2AMD2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd60A2AMD2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd60A2AMD2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd60A2AMD2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd60A2AMD2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd60A2AMD2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd60A2AMD2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd60A2AMD2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd60A2AMD2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd60A2AMD2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd60A2AMD2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd60A2AMD2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ankrd60A2AMD2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd60A2AMD2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd60A2AMD2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd60A2AMD2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd60A2AMD2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd60A2AMD2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd60A2AMD2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd60A2AMD2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd60A2AMD2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd60A2AMD2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd60A2AMD2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd60A2AMD2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd60A2AMD2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd60A2AMD2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd60A2AMD2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd60A2AMD2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd60A2AMD2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd60A2AMD2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd60A2AMD2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ankrd60A2AMD2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd60A2AMD2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd60A2AMD2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd60A2AMD2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd60A2AMD2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd60A2AMD2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd60A2AMD2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd60A2AMD2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd60A2AMD2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd60A2AMD2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd60A2AMD2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ankrd60A2AMD2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd60A2AMD2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd60A2AMD2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd60A2AMD2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd60A2AMD2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd60A2AMD2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd60A2AMD2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd60A2AMD2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd60A2AMD2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd60A2AMD2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd60A2AMD2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd60A2AMD2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd60A2AMD2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd60A2AMD2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd60A2AMD2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd60A2AMD2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd60A2AMD2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ankrd60A2AMD2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd60A2AMD2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd60A2AMD2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd60A2AMD2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd60A2AMD2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd60A2AMD2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd60A2AMD2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd60A2AMD2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd60A2AMD2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd60A2AMD2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd60A2AMD2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd60A2AMD2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd60A2AMD2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ankrd60A2AMD2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd60A2AMD2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd60A2AMD2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd60A2AMD2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd60A2AMD2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ankrd60A2AMD2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd60A2AMD2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms