Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYP6

Sirpb1a, Signal-regulatory protein beta 1A, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sirpb1aA0A0A6YYP6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sirpb1aA0A0A6YYP6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sirpb1aA0A0A6YYP6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sirpb1aA0A0A6YYP6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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