Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trbv23A0A0A6YWQ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trbv23A0A0A6YWQ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv23A0A0A6YWQ1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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