Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm28510A0A087WP28 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gm28510A0A087WP28 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm28510A0A087WP28 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm28510A0A087WP28 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm28510A0A087WP28 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm28510A0A087WP28 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm28510A0A087WP28 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm28510A0A087WP28 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm28510A0A087WP28 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28510A0A087WP28 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm28510A0A087WP28 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm28510A0A087WP28 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm28510A0A087WP28 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm28510A0A087WP28 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm28510A0A087WP28 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm28510A0A087WP28 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm28510A0A087WP28 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm28510A0A087WP28 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm28510A0A087WP28 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm28510A0A087WP28 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm28510A0A087WP28 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm28510A0A087WP28 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm28510A0A087WP28 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm28510A0A087WP28 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm28510A0A087WP28 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm28510A0A087WP28 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm28510A0A087WP28 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm28510A0A087WP28 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm28510A0A087WP28 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm28510A0A087WP28 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm28510A0A087WP28 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm28510A0A087WP28 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm28510A0A087WP28 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm28510A0A087WP28 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm28510A0A087WP28 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm28510A0A087WP28 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm28510A0A087WP28 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm28510A0A087WP28 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm28510A0A087WP28 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm28510A0A087WP28 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm28510A0A087WP28 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm28510A0A087WP28 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm28510A0A087WP28 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
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