Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6C7

Tcrg-C4, T cell receptor gamma, constant 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Tcrg-C4A0A075B6C7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Tcrg-C4A0A075B6C7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Tcrg-C4A0A075B6C7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Tcrg-C4A0A075B6C7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Tcrg-C4A0A075B6C7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Tcrg-C4A0A075B6C7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Tcrg-C4A0A075B6C7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Tcrg-C4A0A075B6C7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Tcrg-C4A0A075B6C7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Tcrg-C4A0A075B6C7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Tcrg-C4A0A075B6C7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,39■■□□□ 1,01
Tcrg-C4A0A075B6C7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Tcrg-C4A0A075B6C7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Tcrg-C4A0A075B6C7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Tcrg-C4A0A075B6C7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Tcrg-C4A0A075B6C7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Tcrg-C4A0A075B6C7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Tcrg-C4A0A075B6C7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Tcrg-C4A0A075B6C7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,34■■□□□ 1,01
Tcrg-C4A0A075B6C7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Tcrg-C4A0A075B6C7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21,31■■□□□ 1
Tcrg-C4A0A075B6C7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
Tcrg-C4A0A075B6C7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Tcrg-C4A0A075B6C7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Tcrg-C4A0A075B6C7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,27■■□□□ 1
Tcrg-C4A0A075B6C7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Tcrg-C4A0A075B6C7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■□□□□ 0,99
Tcrg-C4A0A075B6C7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Tcrg-C4A0A075B6C7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Tcrg-C4A0A075B6C7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Tcrg-C4A0A075B6C7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,23■□□□□ 0,99
Tcrg-C4A0A075B6C7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Tcrg-C4A0A075B6C7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Tcrg-C4A0A075B6C7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21,23■□□□□ 0,99
Tcrg-C4A0A075B6C7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,21■□□□□ 0,99
Tcrg-C4A0A075B6C7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Tcrg-C4A0A075B6C7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Tcrg-C4A0A075B6C7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,17■□□□□ 0,98
Tcrg-C4A0A075B6C7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Tcrg-C4A0A075B6C7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Tcrg-C4A0A075B6C7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Tcrg-C4A0A075B6C7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Tcrg-C4A0A075B6C7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21,14■□□□□ 0,98
Tcrg-C4A0A075B6C7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Tcrg-C4A0A075B6C7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Tcrg-C4A0A075B6C7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Tcrg-C4A0A075B6C7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Tcrg-C4A0A075B6C7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21,11■□□□□ 0,97
Tcrg-C4A0A075B6C7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Tcrg-C4A0A075B6C7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Tcrg-C4A0A075B6C7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Tcrg-C4A0A075B6C7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Tcrg-C4A0A075B6C7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Tcrg-C4A0A075B6C7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Tcrg-C4A0A075B6C7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Tcrg-C4A0A075B6C7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Tcrg-C4A0A075B6C7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Tcrg-C4A0A075B6C7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21,05■□□□□ 0,96
Tcrg-C4A0A075B6C7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Tcrg-C4A0A075B6C7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Tcrg-C4A0A075B6C7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Tcrg-C4A0A075B6C7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21,01■□□□□ 0,95
Tcrg-C4A0A075B6C7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0,95
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Tcrg-C4A0A075B6C7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Tcrg-C4A0A075B6C7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Tcrg-C4A0A075B6C7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Tcrg-C4A0A075B6C7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Tcrg-C4A0A075B6C7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Tcrg-C4A0A075B6C7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Tcrg-C4A0A075B6C7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Tcrg-C4A0A075B6C7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20,95■□□□□ 0,95
Tcrg-C4A0A075B6C7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Tcrg-C4A0A075B6C7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Tcrg-C4A0A075B6C7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Tcrg-C4A0A075B6C7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Tcrg-C4A0A075B6C7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Tcrg-C4A0A075B6C7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Tcrg-C4A0A075B6C7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Tcrg-C4A0A075B6C7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
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