Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TRHRP34981 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRHRP34981 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRHRP34981 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRHRP34981 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms