Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NMNAT2-201ENST00000287713 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRP55822 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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