Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Lsm5-201ENSMUST00000170382 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 3300005D01Rik-204ENSMUST00000181484 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Ngf-204ENSMUST00000198644 1120 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 AC139130.1-201ENSMUST00000228281 620 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 AC151903.1-201ENSMUST00000226677 1423 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gzmg-201ENSMUST00000015578 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm37643-201ENSMUST00000195369 1260 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Dcstamp-204ENSMUST00000227792 1367 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm16334-201ENSMUST00000159488 694 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Trav4-1-201ENSMUST00000199078 330 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Dbil5-201ENSMUST00000040806 581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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DmdP11531 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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DmdP11531 Gm12220-201ENSMUST00000118476 172 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Glns-ps1-201ENSMUST00000120291 1118 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm17868-201ENSMUST00000192761 668 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 AC154669.1-201ENSMUST00000224405 482 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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DmdP11531 Gm22009-201ENSMUST00000158792 343 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm17228-201ENSMUST00000165006 491 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Hbq1a-201ENSMUST00000020535 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 AC162893.1-201ENSMUST00000207732 1085 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 E330011O21Rik-201ENSMUST00000209468 1107 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Wfs1-202ENSMUST00000166339 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
DmdP11531 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
DmdP11531 9530056K15Rik-201ENSMUST00000061947 2315 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm12551-201ENSMUST00000122073 726 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
DmdP11531 Gm6695-201ENSMUST00000177264 1172 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
DmdP11531 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
DmdP11531 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
DmdP11531 Apol7a-204ENSMUST00000176074 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
DmdP11531 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
DmdP11531 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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