Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-AaP01910 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms