Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Use1Q9CQ56 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Use1Q9CQ56 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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