Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gbx1P82976 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gbx1P82976 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gbx1P82976 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gbx1P82976 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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