Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms