Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SEC22BO75396 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SEC22BO75396 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SEC22BO75396 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SEC22BO75396 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SEC22BO75396 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SEC22BO75396 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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