Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms