Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms