Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf16Q9BUW7 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf16Q9BUW7 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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