Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 FXYD2-201ENST00000260287 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 TBC1D21-201ENST00000300504 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 RN7SL322P-201ENST00000583519 299 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 AL590491.2-202ENST00000611126 418 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 AC244197.2-201ENST00000370438 655 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 RN7SL483P-201ENST00000478417 285 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 AC097658.2-201ENST00000512715 624 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 ZNF551-202ENST00000596085 469 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 RIPPLY2-201ENST00000369687 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 AC016304.1-201ENST00000476363 413 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 AC005336.1-201ENST00000585431 1243 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 FAM231B-201ENST00000600179 510 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT140Q96RY7 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms