Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARID5AQ03989 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms