Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TBCCD1Q9NVR7 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms