Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E2F1Q01094 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms