Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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