Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD3P84022 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD3P84022 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms