Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PBLD-207ENST00000495025 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC112200.2-201ENST00000624673 1739 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 MFSD14B-202ENST00000428393 2275 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TMEM19-204ENST00000549735 1772 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AKR1C4-201ENST00000263126 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC138089.1-201ENST00000450847 967 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC02248-202ENST00000451579 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 POLB-211ENST00000521492 786 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC01228-201ENST00000567966 623 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ATXN8OSP0DMR3 AC079210.1-201ENST00000589826 384 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AL031601.2-201ENST00000622823 457 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PTPN20-216ENST00000506080 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 TRIM64EP-201ENST00000531233 1307 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN8OSP0DMR3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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