Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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