Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF9P41273 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms