Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLFML2B-201ENST00000294794 3160 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms