Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HELTA6NFD8 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms