Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VPS18Q9P253 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VPS18Q9P253 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms