Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r46Q9EQ45 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r46Q9EQ45 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms