Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl28Q9D1B9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms