Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM5Q9C035 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms