Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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