Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF7Q9BWX1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms