Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BORCS6Q96GS4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms