Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HJURPQ8NCD3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HJURPQ8NCD3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HJURPQ8NCD3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms