Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc3Q8CHP6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc3Q8CHP6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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