Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LARP1Q6PKG0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LARP1Q6PKG0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LARP1Q6PKG0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms