Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnna2Q61301 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna2Q61301 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms