Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PXDC1Q5TGL8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PXDC1Q5TGL8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms