Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-BQ31612 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-BQ31612 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HLA-BQ31612 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms