Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCINQ13939 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCINQ13939 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCINQ13939 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCINQ13939 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCINQ13939 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCINQ13939 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCINQ13939 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCINQ13939 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCINQ13939 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCINQ13939 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCINQ13939 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCINQ13939 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCINQ13939 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCINQ13939 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCINQ13939 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCINQ13939 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCINQ13939 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCINQ13939 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCINQ13939 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCINQ13939 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCINQ13939 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCINQ13939 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCINQ13939 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCINQ13939 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCINQ13939 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCINQ13939 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCINQ13939 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCINQ13939 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCINQ13939 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCINQ13939 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCINQ13939 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCINQ13939 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCINQ13939 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCINQ13939 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCINQ13939 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCINQ13939 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCINQ13939 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCINQ13939 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCINQ13939 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCINQ13939 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCINQ13939 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCINQ13939 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCINQ13939 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCINQ13939 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCINQ13939 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCINQ13939 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCINQ13939 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCINQ13939 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCINQ13939 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCINQ13939 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCINQ13939 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCINQ13939 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCINQ13939 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCINQ13939 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCINQ13939 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCINQ13939 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCINQ13939 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCINQ13939 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCINQ13939 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCINQ13939 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCINQ13939 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCINQ13939 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCINQ13939 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCINQ13939 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCINQ13939 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCINQ13939 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCINQ13939 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCINQ13939 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCINQ13939 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCINQ13939 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCINQ13939 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCINQ13939 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCINQ13939 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCINQ13939 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCINQ13939 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCINQ13939 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCINQ13939 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCINQ13939 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCINQ13939 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCINQ13939 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCINQ13939 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCINQ13939 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCINQ13939 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCINQ13939 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCINQ13939 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCINQ13939 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCINQ13939 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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