Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAPPAQ13219 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAPPAQ13219 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PAPPAQ13219 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
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