Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 ERG7YHR072W 2196 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 FOL2YGR267C 732 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 SOD1YJR104C 465 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 AAP1YHR047C 2571 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 YML131WYML131W 1098 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 YPL077CYPL077C 723 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 APA2YDR530C 978 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 YDR271CYDR271C 372 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 BNA1YJR025C 534 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 LDB19YOR322C 2457 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 GUP2YPL189W 1830 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 PBS2YJL128C 2007 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 PEX30YLR324W 1572 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 HXT7YDR342C 1713 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 HXT6YDR343C 1713 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 ISA1YLL027W 753 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1B-BLQ12490 PRD1YCL057W 2139 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 CTT1YGR088W 1689 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 MRPL7YDR237W 879 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 MRP21YBL090W 534 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 AAD10YJR155W 867 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 YLR049CYLR049C 1287 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 PBN1YCL052C 1251 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 UBP9YER098W 2265 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 GAS3YMR215W 1575 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 URA4YLR420W 1095 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 NRK1YNL129W 723 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 SKG6YHR149C 2205 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 GDE1YPL110C 3672 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 YDL121CYDL121C 450 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 YGR018CYGR018C 330 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 TDA8YAL064C-A 381 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 POF1YCL047C 777 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 GPP1YIL053W 753 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 COX19YLL018C-A 297 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 YIM1YMR152W 1098 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 YNR061CYNR061C 660 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 ARC40YBR234C 1155 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 TSL1YML100W 3297 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 ALT2YDR111C 1524 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 NOG1YPL093W 1944 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 MRT4YKL009W 711 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 JLP1YLL057C 1239 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 TFC7YOR110W 1308 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 POP4YBR257W 840 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 NUP1YOR098C 3231 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 AIM3YBR108W 2844 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 FRE3YOR381W 2136 nt5.71□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 ALG9YNL219C 1668 nt5.71□□□□□ -1.49
TY1B-BLQ12490 TRM8YDL201W 861 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 YDR056CYDR056C 618 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 CMK1YFR014C 1341 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 HST1YOL068C 1512 nt5.71□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 AIR1YIL079C 1083 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 JIP5YPR169W 1479 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 RMD1YDL001W 1293 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 MRP51YPL118W 1035 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 EMP47YFL048C 1338 nt5.7□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 VID22YLR373C 2706 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 OAR1YKL055C 837 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 CHK1YBR274W 1584 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 LCB2YDR062W 1686 nt5.69□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 RAD2YGR258C 3096 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 RMR1YGL250W 726 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 SOL4YGR248W 768 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 COQ5YML110C 924 nt5.68□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 ADE6YGR061C 4077 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 HOYDL227C 1761 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 YEL045CYEL045C 426 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 YBL036CYBL036C 774 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 COX11YPL132W 903 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt5.67□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 RPG1YBR079C 2895 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 EFM2YBR271W 1260 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 FUN30YAL019W 3396 nt5.66□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 CDC15YAR019C 2925 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 NOC4YPR144C 1659 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 YEL074WYEL074W 339 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 PLP2YOR281C 861 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 TGL4YKR089C 2733 nt5.65□□□□□ -1.5
TY1B-BLQ12490 TPA1YER049W 1935 nt5.65□□□□□ -1.51
TY1B-BLQ12490 ERG5YMR015C 1617 nt5.65□□□□□ -1.51
TY1B-BLQ12490 GLT1YDL171C 6438 nt5.65□□□□□ -1.51
TY1B-BLQ12490 YHR112CYHR112C 1137 nt5.65□□□□□ -1.51
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